搜了一个多小时，网上的办法，加这句话
export SWT_GTK3=0
不好使。还是报错。
后来去论坛搜索
在这个文件
/opt/Xilinx/SDK/2016.3/eclipse/lnx64.o/eclipse.ini
这句话
-vmargs
前面加上
--launcher.GTK_version
2
就好了
参考：
https://bugs.launchpad.net/ubuntu/+source/java-common/+bug/1552764
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