GeoS v2.3分割CT数据

    xiaoxiao2021-03-25  99

    本文仅对如何使用GeoS做简单的CT图像分割做介绍,适合初学者在处理大量实验数据时用,欢迎专业分割领域的大神指正。

    GeoS由微软研究院开发,是一款对医学图像进行交互性的半自动分割的工具。

    1、开始界面

    2、点击LoadVolume,可以加载要进行处理的CT数据,也可以将数据直接点击鼠标左键进行拖拽到用户界面,如下图:

    所选中的三个红色方框,可以进行基础的分割设置,包括画刷的粗细(brush opacity)、显色深浅(brush size)、分割部分显色深浅(segment opacity),分割label设置。通过调节(Window)、(level)可以随时变化CT图像由黑到白的显色情况,调节到较为清晰的状态一遍进行分割。软件进行分割操作的基本操作是:按住shift+鼠标左键表示选中该部分,并且目标为所要分割的部分;按住shift+鼠标右键表示选中该部分,并且表示选中部分计算的时候不应该被保留。然后可以进行计算操作。

    3、导出与导入

    可以将画完的CT保存到文件夹即为导出,包括brush与segment

    也可以将之前画的brush导入到GeoS界面进行二次修改

    通过compute或者直接按F5即可不断计算,得到所要分割的部分。分割部分保存为分割目标的二值图像形式。

    本人非专业的图像分割领域人员,仅仅用到了该工具做数据处理,上手快,节约时间,关于Geos还有很多需要补充的功能介绍,欢

    迎大家批评指正!

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